[Stellenangebote] Vollzeit-Job: Wissenschaftliche(r) Mitarbeiter(in), Drittmittelprojekt ESS-B.A.R (BMBF), FU Berlin

[Marcus Edel]

Liebe Mitglieder der Stellenangebote-Liste,



bitte beachten Sie die folgende Ausschreibung:



http://www.fu-berlin.de/service/stellen/st-2016/st-20160509/index.html




Fachbereich Mathematik und Informatik
Institut für Informatik
Drittmittelprojekt ESS-B.A.R (BMBF)


Wiss. Mitarbeiterin / Wiss. Mitarbeiter
befristet bis 30.04.2019
Entgeltgruppe 13 TV-L FU
Kennung: ess-bar_wimi


Mitarbeit im BMBF Verbund-Projekt “ESS-B.A.R. (Lebensmittelsicherheit und
Resilienz von Lebensmittelwarenketten in biologischen Gefahrenlagen)".
Gesamtziel von Ess-B.A.R. ist die Entwicklung (1) diagnostischer Verfahren
zur frühzeitigen Erkennung des Vorhandenseins hochpathogener zoonotischer
Erreger in der Lebensmittelkette und (2) informationstechnischer Werkzeuge
zur Integration und Auswertung komplexer Daten, um unübersichtliche
Ausbreitungswege besser analysieren zu können bzw. Ausbruchsquellen
schneller zu identifizieren. Neben der Freien Universität sind die
Verbundpartner das BfR, das MPI für Molekulare Genetik, das
Friedrich-Loeffler-Institut (FLI), die PolyAn GmbH sowie die KNIME.com GmbH.


Aufgabengebiet:


Die Position beinhaltet das Entwickeln von C++-Programmen in den
Programmbibliotheken SeqAn und OpenMS sowie die Erstellung von
KNIME-Workflows zur Datenanalyse. Die zu erstellenden Workflows sollen die
folgenden Probleme adressieren: referenzbasierte Genom-Assembly von
Isolaten; Analyse von Metagenom-Experimenten; Analyse von HPLC/MS-basierten
Proteom-Experimenten. Die Position wird eng mit dem neu etablierten
"Bioinformatics Solution Center (BSC)" am Fachbereich Mathematik und
Informatik zusammenarbeiten und verantwortlich sein für die Kommunikation
mit anderen Partnern im Verbundprojekt.


Einstellungsvoraussetzungen:


*	Abgeschlossenes wiss. Hochschulstudium (MSc oder Diplom in
Informatik oder Bioinformatik)
*	Erfahrung in mindestens einem der Gebiete: Proteomik, NGS-basierte
Genomik; Metagenomik


Erwünscht:


*	Einschlägige Promotion oder mehrjährige Forschungserfahrung
*	Erfahrung mit Programmierung in C++
*	Erfahrung in Workflowsystemen, insbesondere KNIME
*	Vertrautheit mit Next Generation Sequencing (NGS) Problemen und
Daten

Bewerbungen sind mit aussagekräftigen Unterlagen bis zum 23.05.2016 unter
Angabe der Kennung im Format PDF und elektronisch per E-Mail zu richten an
(Herr Prof. Dr. Knut Reinert):  <mailto:knut.reinert at fu-berlin.de>
knut.reinert at fu-berlin.de

Mit der Abgabe einer Onlinebewerbung geben Sie als Bewerber/in Ihr
Einverständnis, dass Ihre Daten elektronisch verarbeitet und gespeichert
werden.

Anmerkung des Sekretariats: Bitte fassen Sie Ihre Bewerbungsunterlagen in
EINER (1) PDF-Datei zusammen!


Mit freundlichen Grüßen
Anja Kasseckert



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- Sekretariat Prof. Knut Reinert, AG Algorithmische Bioinformatik -
- Sekretariat Prof. Rosario M. Piro, AG Computational Neuropathology &
Oncology -
- Sekretariat Prof. Annalisa Marsico, AG High Throughput Genomics -

Freie Universität Berlin
Institut für Informatik
Anja Kasseckert
Takustraße 9
14195 Berlin
Germany

Fon:  +49 (0)30 838-75237
Fax:   +49 (0)30 838-472609
Email:    anja.kasseckert at fu-berlin.de

http://www.inf.fu-berlin.de/en/groups/abi

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Dateityp    : application/pdf
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Beschreibung: nicht verfügbar
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