[Stellenangebote] Optimierung math. Modell eines biophys./biolog. Systems | FMP | Berlin

[Nitschke, Norma]

[ English Version below]

 

Sehr geehrte Studierende der Informatik, Bioinformatik, Softwaretechnik oder
einer verwandten Disziplin,

 

Stellenbeschreibung:

Werden Sie Teil unserer hochgradig internationalen und interdisziplinären
biomedizinischen Forschungsgruppe als Studentische Hilfskraft, wo Sie eine
wichtige Rolle bei der Verbesserung eines Programms spielen werden, das wir
entwickelt haben, um ein biophysikalisches/biologisches System im Laufe der
Zeit mit einer Reihe von Differentialgleichungen mathematisch zu
modellieren. Das bestehende Programm, das in Python geschrieben ist, muss
sowohl hinsichtlich der Effizienz der Berechnungen als auch der
Benutzerfreundlichkeit verbessert werden. Wir suchen eine Person, die das
Programm umstrukturieren kann, um es schneller und flexibler zu machen, und
um es für biomedizinische Forscher ohne Programmierkenntnisse leichter
zugänglich zu machen. Idealerweise interessiert sich der/die Kandidat/-in
für den (bio)physikalischen Hintergrund des Modells.

 

Hauptaufgaben:

- Analyse und Umstrukturierung des bestehenden mathematischen
Modelllösungsprogramms zur Verbesserung von Effizienz und Geschwindigkeit.

- Entwurf und Implementierung einer benutzerfreundlichen Schnittstelle, die
eine einfache Manipulation der Eingabeparameter sowie das Einfügen neuer
"Spieler" in das Modell ermöglicht.

- Optimierung der Leistung des Programms, um es schneller laufen zu lassen.

- Schaffung von Optionen zur automatischen Veränderung der Eingabeparameter
in bestimmten Bereichen und Darstellung der Ergebnisse als Funktion der Zeit
und der Parameter.

- Zusammenarbeit mit Forschern, um Benutzeranforderungen zu verstehen und
Feedback in das Programmdesign zu integrieren.

- Dokumentieren Sie Änderungen und erstellen Sie Benutzerrichtlinien, um
eine reibungslose Benutzererfahrung zu ermöglichen.

 

Anforderungen:

- Derzeitiges Bachelor- oder Master-Studium in Informatik, Bioinformatik,
Softwaretechnik oder einer verwandten Disziplin.

- Sehr gute Kenntnisse in Python mit Erfahrung in der Leistungsoptimierung
von Code.

- Erfahrung mit numerischen Methoden und dem Lösen von
Differentialgleichungen.

- Gute Englischkenntnisse (mindestens B2-Niveau) mit ausgezeichneten
Kommunikationsfähigkeiten.

- Eine proaktive Herangehensweise an die Problemlösung und die Bereitschaft,
sich in neue Technologien einzuarbeiten.

 

Die Vergütung entspricht 13 EUR/Stunde. Arbeitsumfang ca. 9,5 Stunden/Woche
oder mehr.

 

Kontakt:  Dr. Norma Nitschke:  <mailto:nitschke at fmp-berlin.de>
nitschke at fmp-berlin.de

Lab of Prof. Thomas J. Jentsch (https://leibniz-fmp.de/jentsch) 

Leibniz-Forschungsinstitut für Molekulare Pharmakologie (FMP), Campus Buch,
Robert-Rössle-Straße 10, 13125 Berlin

Bitte senden Sie Ihre Bewerbung oder etwaige Fragen per E-Mail an mich. 

Wir freuen uns auf Sie.

 

Mit besten Grüßen,

Norma Nitschke

 

 

Dr. Norma Nitschke
----------------------------------------------------------------------------
-
Leibniz-Forschungsinstitut für Molekulare Pharmakologie (FMP)

- Physiology & Pathology of Ion Transport –

  (Thomas Jentsch)

Robert-Rössle-Str. 10
13125 Berlin

Germany

Phone:  +493094793520
Fax:        +493094973529

E-Mail:   <mailto:NITSCHKE at fmp-berlin.de> NITSCHKE at fmp-berlin.de
Web:      <http://www.leibniz-fmp.de/> www.leibniz-fmp.de 
----------------------------------------------------------------------------
-

 

Dear Bachelor or Master students of Computer Sciences, Software Engineering,
or related disciplines.

 

Position overview:

Join our highly international and interdisciplinary biomedical research
group as a Student Assistant (Studentische Hilfskraft), where you’ll play an
important role in improving a software we have developed to mathematically
model a biophysical/biological system over time with a set of differential
equations. The existing software, written in Python, needs to be improved
both concerning the efficiency of calculations and user friendliness. We are
searching for a person, who can restructure the program to make it faster
and more flexible, and to make it more easily accessible for biomedical
researchers without a background in programming. Ideally the candidate would
be interested in the (bio)physical background of the model.

 

Key responsibilities:

- Analyze and restructure the existing mathematical model-solving program
for improved efficiency and speed.

- Design and implement a user-friendly interface that allows for easy
manipulation of input parameters, as well as insertion of new ‘players’ into
the model

- Optimize the program’s performance to run it faster

- Create options to automatically vary input parameters in certain ranges
and plot results as function of time and parameters  

- Collaborate with researchers to understand user requirements and integrate
feedback into the program design.

- Document modifications and create user guidelines to facilitate a smooth
user experience.

 

Requirements:

- Currently pursuing a Bachelor’s or Master’s degree in Computer Science,
Software Engineering, or related discipline.

- Strong proficiency in Python, with experience in optimizing code for
performance.

- Experience with numerical methods and solving differential equations.

- Proficiency in English (B2 level or higher), with excellent communication
skills.

- A proactive approach to problem-solving and eagerness to learn new
technologies.

 

The salary for the student assistant position is 13,- EUR/hour. We
anticipate a work load of 9,5 hrs. per week (or more).

 

Contact:  Dr. Norma Nitschke: nitschke at fmp-berlin.de
<mailto:nitschke at fmp-berlin.de> 

Lab of Prof. Thomas J. Jentsch (https://leibniz-fmp.de/jentsch) 

Leibniz-Forschungsinstitut für Molekulare Pharmakologie (FMP), Campus Buch,
Robert-Rössle-Straße 10, 13125 Berlin

Please send your applications and any questions you may have to me by email.

We are looking forward to meeting you!

 

Best regards,

Norma Nitschke