[Stellenangebote] Diplom-/Masterarbeit: Bioinformatik Bereich: Systembiologie/ Nanotoxikologie, Bundesinstitut für Risikobewertung (BfR) & Robert Koch-Institut (RKI), Berlin

[Marcus Edel]

Diplom- bzw. Masterarbeit im Themenbereich: Systembiologie/ Nanotoxikologie

Hintergrund: Nanotechnologie gilt als eine der Zukunftstechnologien des 21.
Jahrhunderts und bringt eine vielfältige und ständig wachsende Zahl von
neuen Materialien hervor. Zur Bewertung möglicher Gesundheitsrisiken von
Nanomaterialien (NM) werden zunehmend auch systembiologische Methoden
eingesetzt. In diesem Projekt werden Transkriptom-, Proteom- und Metabolom-
Daten aus in vitro und in vivo Versuchen kombiniert, um durch eine
übergeordnete Analyse und Auswertung die den adversen Effekten zugrunde
liegenden Toxizitätsmechanismen zu verstehen. Ein weiteres Ziel in diesem
Projekt ist es, auf Basis der Wirkmechanismen Gruppierungskriterien zu
identifizieren und NM mit ähnlichen Wirkmechanismen in Gruppen
zusammenzufassen. Die Etablierung von Gruppierungsstrategien kann die
Risikobewertung von NM deutlich vereinfachen.

Eingesetzt werden Methoden aus der Bioinformatik bzw. der multivariaten
Statistik wie z.B.:

-    Clusteranalysen
-    Hauptkomponentenanalysen
-    Random Forrest o.ä.

Vorausgesetzt wird ein naturwissenschaftliches Studium, vorzugsweise
Bioinformatik oder aber Chemie bzw. Biochemie o.ä., wenn Grundkenntnissen
der Modellierungstechniken, der Systembiologie und Systemtheorie vorhanden
sind. Weiterhin werden gute Kenntnis der statistischen Datenanalyse (in R,
Knime, SIMCA o.ä.) vorausgesetzt.

Die Arbeit erfolgt im Rahmen eines kürzlich gestarteten ERANET SIINN
Projekt NanoToxClass in Zusammenarbeit zwischen dem Bundesinstitut für
Risikobewertung (BfR) und dem Robert- Koch- Institut (RKI).
Das BfR ist eine rechtsfähige Anstalt im Geschäftsbereich des
Bundesministeriums für Ernährung und Landwirtschaft (BMEL) und erstellt auf
der Grundlage international anerkannter wissenschaftlicher
Bewertungskriterien Gutachten und Stellungnahmen zu Fragen der
Lebensmittel-, Futtermittel- und Chemikaliensicherheit und des
gesundheitlichen Verbraucherschutzes erstellt.
Das Robert Koch-Institut (RKI) ist ein Bundesinstitut im Geschäftsbereich
des Bundesministeriums für Gesundheit. Das RKI ist die zentrale Einrichtung
der Bundesregierung auf dem Gebiet der Krankheitsüberwachung und
-prävention und damit auch die zentrale Einrichtung des Bundes auf dem
Gebiet der anwendungs- und maßnahmenorientierten biomedizinischen
Forschung.

Eine universitäre Betreuung ist am FB Mathematik und Informatik der FU
Berlin möglich.

Kontakt:
Dr. Andrea Haase
andrea.haase at bfr.bund.de

PD Dr. Bernhard Renard
RenardB at rki.de // renard at mi.fu-berlin.de
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