[Stellenangebote] Master-Arbeit – XNAT D-Grid Connector

[Oberwahrenbrock, Timm]

Master-Arbeit – “XNAT D-Grid Connector”

NeuroCure Clinical Research Center NCRC und Institut für Medizinische Informatik

Ab sofort ist folgendes Thema für eine Abschlussarbeit verfügbar:

Hintergrund:
XNAT ist ein modernes, web-basiertes Open-Source-Management-Tool für neurowissenschaftliche Bild- und Forschungsdaten. Es ist weltweit in klinischen Forschungszentren wie zum Beispiel der Harvard University, Washington University und auch dem NCRC in Berlin im Einsatz.
Im D-Grid sind nationale Hochleistungsrechenzentren mittels einer gemeinsamen Service-Infrastruktur zu einem Grid-Provider verbunden. Auf dem Grid können rechenaufwendige Prozesse, wie sie zum Beispiel bei der Analyse von neurowissenschaftlichen Bilddaten anfallen, durch massiv-parallele Bearbeitung in kurzer Zeit bewältigt werden.

Thema:
In dieser Arbeit soll ein XNAT  Plugin zur Anbindung an das D-Grid entwickelt werden. Neurowissenschaftliche Bilddaten sollen zu Analysezwecken an das Grid geschickt werden können, Ergebnisse anschließend aus dem Grid in XNAT eingebunden werden.
Es existieren bereits benötigte, grid-fähige Anwendungen auf dem D-Grid und die erforderlichen Sicherheitskonzepte und Datenschutzkonzepte. Eine von der Charité entwickelte Web-Oberfläche außerhalb von XNAT ist ebenfalls vorhanden und kann als Vorlage dienen.
Die Arbeit erfolgt in enger Zusammenarbeit mit Ärzten und Wissenschaftlern und der gfnmediber GmbH am Campus Mitte der Charité - Universitätsmedizin Berlin. Anspruchsvolles Arbeiten in einem interdisziplinären Team ist garantiert!

Inhalte:
Analyse von Anforderungen und Anwendungsszenarien
Modellierung von Prozess- und Datenflüssen
Einarbeitung in die D-Grid Service Struktur und Aufsetzen von relevanten, existierenden grid-fähigen Diensten für konkrete Anwendungsszenarien
Konzeption, Design und Entwicklung eines web-basierten Plugins in Java, JSP, XML, Velocity und Turbine für XNAT
Bei Interesse kann die Arbeit mit einer Werkstudentenposition zur Betreuung des XNAT Systems am NCRC kombiniert werden.
Ein wissenschaftlicher Anschluss ist bei Interesse und entsprechender Eignung möglich.

Ansprechpartner:
Dr. rer. nat. Dagmar Krefting
Institut für Medizinische Informatik
Charité - Universitätsmedizin Berlin

Hindenburgdamm 30
12200 Berlin
Tel: +49-30-450-544515
dagmar.krefting at charite.de

-------------- nächster Teil --------------
Ein Dateianhang mit Binärdaten wurde abgetrennt...
Dateiname   : NCRC XNAT D-Grid Connector.doc
Dateityp    : application/msword
Dateigröße  : 42496 bytes
Beschreibung: NCRC XNAT D-Grid Connector.doc
URL         : <https://lists.spline.inf.fu-berlin.de/mailman/private/stellenangebote/attachments/20110210/8340d0aa/attachment.doc>